子宮輸卵管通水檢查的方法雖然應用廣泛，但其誤診率較高。由于整個通水檢查的過程都需要醫(yī)生依靠主觀感覺進行手動操作，所以，此方法造成假性診斷的幾率較高。此外，被檢查者在做檢查時的緊張情緒也會影響輸卵管通水檢查的結果。

可破壞輸卵管的功能很多慢性婦科炎癥都可導致輸卵管黏膜發(fā)生粘連，進行輸卵管通水檢查雖然對由輸卵管黏膜粘連所引起的輸卵管阻塞有一定的治療作用，但對于輸卵管黏膜粘連較嚴重的被檢查者來說，反復進行輸卵管通水檢查可導致許多不良的后果。在進行輸卵管通水檢查時，所用的注射液會將粘連部位的病菌帶入盆腔，引起炎癥擴散，以致出現(xiàn)更嚴重的后果。反復進行輸卵管通水檢查可破壞輸卵管自身的蠕動功能和輸卵管管壁纖毛的擺動功能，從而影響受精卵的著床，降低被檢查者受孕的幾率。